广东省科学院微生物研究所章卫民研究员团队发现新型分子间Diels-Alder环化酶
近期,广东省科学院微生物研究所章卫民研究员团队发表了题为《负责新颖异二聚体生物合成新颖单功能分子间Diels-Alder环化酶的发现》(The discovery of a novel single-function intermolecular Diels-Alder enzyme for the biosynthesis of hetero-dimer lithocarpins)的研究论文,该团队发现了一种负责聚酮类异二聚体lithocarpins生物合成的新型分子间Diels-Alder环化酶,该酶可以通过合成生物学显著提升lithocarpins的产量。Lithocarpins为分离自海洋真菌Phomopsis lithocarpus的聚酮类新骨架化合物,具有开发成为新型抗肿瘤药物先导化合物的潜力。相关成果发表在中科院化学一区top期刊《国际大分子杂志》(International Journal of Biological Macromolecules)上。
该研究团队前期从深海真菌Phomopsis lithocarpus中获得了7个具有抗肿瘤活性的十元大环内酯杂合tenellone异二聚体聚酮类新骨架化合物lithocarpins A-G ,其中 lithocarpin E对肝癌细胞具有选择性毒性,并进一步证实了lithocarpins类似物在小鼠体内的抗肝癌活性,预示lithocarpins具有开发成为特异性抗肝癌药物先导化合物的潜力。DA酶在复杂聚酮类化合物的生物合成过程中发挥重要作用,但目前已报道的DA酶大多是多功能分子内DA酶。因此,需要进一步挖掘具有高立体选择性的单功能分子间DA酶,为生物合成新颖的异二聚体聚酮类新化合物提供可靠的酶学工具。该论文通过对P. lithocarpus关键基因敲除证实lithocarpins由两个基因簇cluster 41和cluster 81分别生物合成十元大环内酯和tenellone,再通过新型分子间DA酶g7882介导的Diels-Alder(DA)环化反应形成,进一步对修饰基因酰基转移酶GPAT进行基因敲除,证实了酰基转移酶(GPAT)负责lithocarpin B到lithocarpin A的乙酰化。通过对GPAT的过表达显著提升了抗肿瘤化合物lithocarpin A的产量,同时发掘了一个具有显著抗肿瘤和抗菌活性的新化合物lithocarol G,并对GPAT的多重生化功能及lithocarol的生物合成机制进行了解析。
图2 lithocarpins合成机制推测及其高效生物合成策略
Phomopsis lithocarpus中分子间DA酶g7882的过表达能显著提升lithocarpin A的产量,同时降低前体tenellone B的产量,从而发掘了首例介导异戊烯基二苯酮化合物和大环内酯的单功能分子间DA酶。为了进一步验证g7882 DA酶的体外生化功能和底物谱,该论文将g7882 DA在大肠杆菌中进行表达纯化,并以tenellone和十二元大环内酯为底物验证了其DA酶活性及其具有底物宽泛性。该研究结果将加深人们对于DA酶介导的新颖异二聚体聚酮类化合物生物合成机制及新型单功能分子间DA酶g7882催化机制的科学认知,同时促进聚酮类异二聚体类抗肝癌药物先导化合物的开发和应用。
图3 tenellone生物合成机制推测及新颖DA分子间DA酶g7882的功能鉴定
论文的第一作者为叶伟研究员,通讯作者为章卫民研究员。研究得到了国家自然科学基金(32370081, 32200039),广东省自然资源厅海洋经济发展专项(GDNRC [2021]054, [2020]042),广东省科学院发展专项资金(2021GDASYL-20210103021)等项目的资助。
文章链接:https://doi.org/10.1016/j.ijbiomac.2024.132539
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