广东省科学院微生物研究所长期致力于具有热带、亚热带特色功能微生物资源的发掘保护和开发利用，建成华南地区具有重要影响力的农业微生物战略资源库，选育出了一批高性能菌株，开发出了新型多功能肥料等高性能产品10余个，累计推广面积300多万亩，提供菌种服务3万多株次、技术服务1.5万余次，为我国农业的绿色高质量发展提供了重要支撑。研究成果获广东省科技进步奖一等奖2项（2020年；2014年）、其他省部级科技奖励5项，其中“农业微生物资源高效利用技术及产业化”入选了“十三五”广东省十大农业科技标志性成果。